O destino do Aquabus deve ser definido pela população de Ilhabela em audiência pública. A decisão foi anunciada pela Prefeitura, porém nenhuma data foi estabelecida para o encontro. As três embarcações custaram mais de R$ 4 milhões aos cofres públicos e estão há meses ancoradas na Marina Juqueriquerê, na cidade de Caraguatatuba.
Em 2015, o Ministério Público do Tribunal de Contas do Estado de São Paulo apontou diversas irregularidades cometidas no procedimento de aquisição dos ônibus aquáticos. Os barcos foram comprados e entregues sem a certificação para a navegação; sem o estudo de viabilidade socioeconômica para a operacionalidade (sem estudo sobre subsídio); sem adequação dos píeres e embarcações para acessibilidade; e também sem investimentos para abrigo dos passageiros nos píeres; além de entre outros problemas legais.
Logo de início também foi constatado que as mesmas necessitam de reparos que ficariam em torno de R$ 900 mil, mais o estudo de viabilidade econômica, em torno de R$ 100 mil. Outro gasto necessário será a adequação dos píeres, o que não foi feito pela administração passada, antes da compra dos barcos. Antes os mesmos ficavam no Yate Clube com risco de afundamento, devido a possibilidade de novos acidentes.
Nas próximas semanas a Prefeitura de Ilhabela informará o dia e o horário da audiência pública para a discussão e definição sobre os “Aquabus”.